Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer1Q9Z2Y3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer1Q9Z2Y3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms