Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gria3Q9Z2W9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria3Q9Z2W9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria3Q9Z2W9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms