Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc23a1Q9Z2J0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc23a1Q9Z2J0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms