Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mbd3Q9Z2D8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mbd3Q9Z2D8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms