Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip6Q9Z1Y4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trip6Q9Z1Y4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms