Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc45Q9Z1X9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc45Q9Z1X9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms