Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfrp4Q9Z1N6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms