Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx39bQ9Z1N5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms