Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rspo1Q9Z132 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rspo1Q9Z132 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms