Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z117

Zfp53, KRAB-containing zinc-finger protein KRAZ1, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp53Q9Z117 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp53Q9Z117 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp53Q9Z117 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms