Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hmg20bQ9Z104 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms