Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skp2Q9Z0Z3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms