Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp46a1Q9WVK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp46a1Q9WVK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms