Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnip1Q9WUU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnip1Q9WUU8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms