Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uchl5Q9WUP7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl5Q9WUP7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl5Q9WUP7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms