Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn3Q9WUK7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn3Q9WUK7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms