Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms