Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vax2Q9WTP9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms