Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggps1Q9WTN0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms