Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf103Q9R1W3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf103Q9R1W3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf103Q9R1W3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf103Q9R1W3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms