Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma4Q9R1P0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms