Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf7Q9R1C0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf7Q9R1C0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf7Q9R1C0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf7Q9R1C0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms