Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slit2Q9R1B9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slit2Q9R1B9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms