Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trex2Q9R1A9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms