Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a4Q9R155 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms