Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod1Q9R0E2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod1Q9R0E2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms