Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf346Q9R0B7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms