Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek3Q9R0A5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms