Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkab1Q9R078 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkab1Q9R078 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkab1Q9R078 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms