Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcamQ9R069 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms