Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AmfrQ9R049 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AmfrQ9R049 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms