Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcf1Q9QZM3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms