Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk3Q9QZL0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk3Q9QZL0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms