Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg1Q9QZE5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms