Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nr4a3Q9QZB6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a3Q9QZB6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms