Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms