Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc39a1Q9QZ03 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc39a1Q9QZ03 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc39a1Q9QZ03 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms