Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Rdh11Q9QYF1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms