Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clic4Q9QYB1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms