Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp3Q9QY23 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms