Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer2Q9QWW1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 938.2 ms