Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt17Q9QWL7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt17Q9QWL7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt17Q9QWL7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms