Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma6Q9QUM9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psma6Q9QUM9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms