Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl2Q9QUK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl2Q9QUK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms