Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoaQ9QUI0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhoaQ9QUI0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms