Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl3Q9JMG7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms