Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt1Q9JMD1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Sfmbt1Q9JMD1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms