Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SrfQ9JM73 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrfQ9JM73 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SrfQ9JM73 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms