Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2l2Q9JLG4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms