Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms